Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP88Q99567 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP88Q99567 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms