Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UHRF1Q96T88 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms