Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT7

TUBGCP6, Gamma-tubulin complex component 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP6Q96RT7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TUBGCP6Q96RT7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TUBGCP6Q96RT7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TUBGCP6Q96RT7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TUBGCP6Q96RT7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TUBGCP6Q96RT7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TUBGCP6Q96RT7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TUBGCP6Q96RT7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TUBGCP6Q96RT7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TUBGCP6Q96RT7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TUBGCP6Q96RT7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms