Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms