Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD3Q96L08 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms