Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDLIM2Q96JY6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms