Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC41A2Q96JW4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms