Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms