Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms