Protein–RNA interactions for Protein: Q96IR7

HPDL, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPDLQ96IR7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPDLQ96IR7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPDLQ96IR7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPDLQ96IR7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPDLQ96IR7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPDLQ96IR7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HPDLQ96IR7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPDLQ96IR7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPDLQ96IR7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPDLQ96IR7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPDLQ96IR7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPDLQ96IR7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPDLQ96IR7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HPDLQ96IR7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPDLQ96IR7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPDLQ96IR7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPDLQ96IR7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms