Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGAP3Q96FM1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGAP3Q96FM1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms