Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB3CQ96E17 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms