Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EDAQ92838 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDAQ92838 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDAQ92838 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDAQ92838 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EDAQ92838 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDAQ92838 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDAQ92838 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDAQ92838 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDAQ92838 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDAQ92838 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EDAQ92838 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDAQ92838 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDAQ92838 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDAQ92838 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDAQ92838 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDAQ92838 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDAQ92838 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDAQ92838 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EDAQ92838 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDAQ92838 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDAQ92838 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDAQ92838 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDAQ92838 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDAQ92838 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDAQ92838 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDAQ92838 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDAQ92838 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDAQ92838 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDAQ92838 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDAQ92838 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDAQ92838 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDAQ92838 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EDAQ92838 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDAQ92838 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDAQ92838 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDAQ92838 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDAQ92838 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDAQ92838 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDAQ92838 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDAQ92838 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDAQ92838 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDAQ92838 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDAQ92838 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDAQ92838 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDAQ92838 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDAQ92838 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDAQ92838 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EDAQ92838 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDAQ92838 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDAQ92838 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDAQ92838 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDAQ92838 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDAQ92838 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDAQ92838 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDAQ92838 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDAQ92838 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EDAQ92838 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDAQ92838 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDAQ92838 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDAQ92838 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDAQ92838 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDAQ92838 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDAQ92838 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EDAQ92838 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDAQ92838 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDAQ92838 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDAQ92838 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDAQ92838 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDAQ92838 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDAQ92838 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDAQ92838 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDAQ92838 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EDAQ92838 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EDAQ92838 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EDAQ92838 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EDAQ92838 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDAQ92838 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDAQ92838 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDAQ92838 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDAQ92838 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EDAQ92838 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EDAQ92838 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EDAQ92838 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDAQ92838 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDAQ92838 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDAQ92838 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDAQ92838 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDAQ92838 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDAQ92838 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDAQ92838 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDAQ92838 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDAQ92838 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDAQ92838 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDAQ92838 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDAQ92838 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDAQ92838 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDAQ92838 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDAQ92838 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EDAQ92838 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms