Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF516Q92618 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF516Q92618 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms