Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PYDC1Q8WXC3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PYDC1Q8WXC3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms