Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms