Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBA3Q8TBC4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBA3Q8TBC4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms