Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTLL11Q8NHH1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms