Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LPCAT1Q8NF37 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms