Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COLGALT1Q8NBJ5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms