Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FSIP1Q8NA03 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms