Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIML1Q8N9V2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms