Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8P6

Putative uncharacterized protein FLJ39060, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N8P6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8N8P6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8N8P6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8N8P6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8N8P6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8N8P6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8N8P6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8N8P6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8N8P6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8N8P6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8N8P6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8N8P6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8N8P6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8N8P6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8N8P6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8N8P6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8N8P6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8N8P6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8N8P6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8N8P6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8N8P6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8N8P6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8N8P6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8N8P6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8N8P6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8N8P6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8N8P6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8N8P6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8N8P6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8N8P6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8N8P6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8N8P6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8N8P6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8N8P6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8N8P6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8N8P6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8N8P6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8N8P6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8N8P6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8N8P6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8N8P6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8N8P6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8N8P6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8N8P6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8N8P6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8N8P6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8N8P6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8N8P6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8N8P6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8N8P6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8N8P6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8N8P6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8N8P6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8N8P6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8N8P6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8N8P6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8N8P6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8N8P6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8N8P6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8N8P6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8N8P6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8N8P6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8N8P6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8N8P6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8N8P6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8N8P6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8N8P6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8N8P6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8N8P6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8N8P6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8N8P6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8N8P6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8N8P6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8N8P6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8N8P6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8N8P6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8N8P6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8N8P6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8N8P6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8N8P6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8N8P6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8N8P6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8N8P6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8N8P6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8N8P6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8N8P6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8N8P6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8N8P6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8N8P6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8N8P6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8N8P6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8N8P6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8N8P6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q8N8P6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q8N8P6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q8N8P6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q8N8P6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q8N8P6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q8N8P6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q8N8P6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms