Protein–RNA interactions for Protein: Q8N350

CBARP, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBARPQ8N350 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBARPQ8N350 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms