Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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CA13Q8N1Q1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CA13Q8N1Q1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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CA13Q8N1Q1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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CA13Q8N1Q1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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CA13Q8N1Q1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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CA13Q8N1Q1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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