Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC47Q8N1G4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC47Q8N1G4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms