Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD4Q8IYR2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms