Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC6Q8IVU3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms