Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXP4Q8IVH2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FOXP4Q8IVH2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXP4Q8IVH2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms