Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PLD3Q8IV08 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLD3Q8IV08 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms