Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF554Q86TJ5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms