Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP6Q7Z6E9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP6Q7Z6E9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP6Q7Z6E9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP6Q7Z6E9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP6Q7Z6E9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP6Q7Z6E9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP6Q7Z6E9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP6Q7Z6E9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP6Q7Z6E9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP6Q7Z6E9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP6Q7Z6E9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP6Q7Z6E9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP6Q7Z6E9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP6Q7Z6E9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP6Q7Z6E9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RBBP6Q7Z6E9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBBP6Q7Z6E9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms