Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
OTOP1Q7RTM1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.3 ms