Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC24A5Q71RS6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC24A5Q71RS6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC24A5Q71RS6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms