Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAXIP1Q6ZW49 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms