Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms