Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF493Q6ZR52 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF493Q6ZR52 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF493Q6ZR52 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF493Q6ZR52 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF493Q6ZR52 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF493Q6ZR52 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF493Q6ZR52 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF493Q6ZR52 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF493Q6ZR52 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF493Q6ZR52 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF493Q6ZR52 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms