Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN5

FOXI2, Forkhead box protein I2, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI2Q6ZQN5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXI2Q6ZQN5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXI2Q6ZQN5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms