Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY4Q6ZNE9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms