Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCBE1Q6UXH8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCBE1Q6UXH8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms