Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms