Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM220Q6QAJ8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms