Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1N0

CC2D1A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1AQ6P1N0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1AQ6P1N0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1AQ6P1N0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1AQ6P1N0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1AQ6P1N0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1AQ6P1N0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1AQ6P1N0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1AQ6P1N0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1AQ6P1N0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1AQ6P1N0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1AQ6P1N0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1AQ6P1N0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1AQ6P1N0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1AQ6P1N0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1AQ6P1N0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CC2D1AQ6P1N0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1AQ6P1N0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms