Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD4Q6NW29 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD4Q6NW29 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD4Q6NW29 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD4Q6NW29 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD4Q6NW29 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD4Q6NW29 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD4Q6NW29 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD4Q6NW29 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD4Q6NW29 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD4Q6NW29 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD4Q6NW29 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD4Q6NW29 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD4Q6NW29 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD4Q6NW29 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD4Q6NW29 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms