Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms