Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms