Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
C9orf84Q5VXU9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
C9orf84Q5VXU9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
C9orf84Q5VXU9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
C9orf84Q5VXU9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
C9orf84Q5VXU9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
C9orf84Q5VXU9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
C9orf84Q5VXU9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
C9orf84Q5VXU9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
C9orf84Q5VXU9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
C9orf84Q5VXU9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
C9orf84Q5VXU9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
C9orf84Q5VXU9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
C9orf84Q5VXU9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
C9orf84Q5VXU9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
C9orf84Q5VXU9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
C9orf84Q5VXU9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
C9orf84Q5VXU9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
C9orf84Q5VXU9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
C9orf84Q5VXU9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
C9orf84Q5VXU9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
C9orf84Q5VXU9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms