Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXT5

SYPL2, Synaptophysin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL2Q5VXT5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYPL2Q5VXT5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYPL2Q5VXT5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYPL2Q5VXT5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYPL2Q5VXT5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYPL2Q5VXT5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYPL2Q5VXT5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYPL2Q5VXT5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYPL2Q5VXT5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYPL2Q5VXT5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYPL2Q5VXT5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms