Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM6

PRAMEF13, Putative PRAME family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF13Q5VWM6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF13Q5VWM6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms