Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C3orf38Q5JPI3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C3orf38Q5JPI3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms